הוועדה העצמאית, שהוקמה על ידי מועצת זכויות האדם של האו"ם, הגישה את מסקנותיה ואמרה כי בכל "הנוגע לפעולות הצבאיות של ישראל בעזה, ישראל ביצעה פשעי מלחמה, פשעים נגד האנושות והפרות של חוקים הומניטריים וזכויות אדם בינלאומיים".
מהדו"ח של הוועדה עולה בין היתר, כי הצהרות של גורמים ישראליים - לרבות אלה המשקפות את המדיניות של גרימת הרס נרחב והרג מספר רב של אזרחים - עלו כהסתה ועשויות להוות פשעים בינלאומיים חמורים אחרים.
"הסתה ישירה וציבורית לרצח עם היא פשע על פי החוק הבינלאומי בכל פעם שהוא מבוצע, אפילו על ידי אנשים שאין להם סמכות ישירה לביצוע פעולות האיבה. הסתה לאפליה, עוינות או אלימות היא הפרה חמורה של חוק זכויות האדם הבינלאומי ועלולה להסתכם בפשע בינלאומי", נכתב בדו"ח.
"זה הכרחי שכל מי שביצעו פשעים יישא באחריות", אמרה נאווי פילאי, יו"ר הוועדה.
"על ישראל להפסיק לאלתר את פעולותיה והתקפותיה הצבאיות בעזה, כולל ההתקפה על רפיח, שעלתה בחייהם של מאות אזרחים ושוב עקירה מאות אלפי אנשים למקומות לא בטוחים ללא שירותים בסיסיים וסיוע הומניטרי", הוסיפה פילאי.
בנוגע למבצעים צבאיים והתקפות ישראל בעזה, הוועדה מצאה כי הרשויות הישראליות אחראיות לפשעי מלחמה שכללו; הרעבה כשיטת לוחמה, רצח או הרג מכוון תוך הכוונת המתקפה למקומות הומי אדם, פינוי בכפייה, אלימות מינית, עינויים ומעצר שרירותי. 
המספר העצום של נפגעים אזרחיים בעזה וההשמדה הנרחבת של תשתיות אזרחיים היו תוצאה בלתי נמנעת של אסטרטגיה שננקטה במטרה לגרום לנזק מירבי, תוך התעלמות מעקרונות ההבחנה, המידתיות ואמצעי זהירות נאותים.
"שימוש מכוון בנשק כבד בעל כושר הרס גדול באזורים צפופים מהווה התקפה מכוונת וישירה על האוכלוסייה האזרחית", נכתב בדו"ח.
למרות שישראל הוציאה מאות צווי פינוי לאנשים בצפון עזה ובמקומות אחרים, הוועדה מצאה כי הם לעיתים לא מספיקים, לא ברורים ומנוגדים, ולא סיפקו זמן הולם לפינוי בטוח. כמו כן, נתיבי הפינוי והאזורים המוגדרים כבטוחים הותקפו באופן עקבי על ידי כוחות ישראליים. 
עוד, הוועדה קבעה כי ישראל הטילה "מצור מוחלט" המהווה ענישה קולקטיבית נגד האוכלוסייה האזרחית. "הרשויות הישראליות ניצלו את המצור והשתמשו באספקת מצרכי חיים, לרבות על ידי ניתוק מים, מזון, חשמל, דלק וסיוע הומניטרי, להישגים אסטרטגיים ופוליטיים", נאמר.
הדו"ח עוד הצביע על צורות ספציפיות של אלימות מינית ומגדרית שמהוות חלק מנוהלי הפעולה של כוחות הביטחון הישראליים. את הממצא ניתן להוכיח בשל התדירות, השכיחות והחומרה של ההפרות, הכוללות הפשטה פומבית ועירום שנועדו להשפיל את הקהילה בכללותה ולהדגיש את כפיפותו של עם כבוש.
הדו"ח קורא בהמלצותיו לממשלת ישראל ליישם לאלתר הפסקת אש, להפסיק את המצור על עזה, להבטיח מתן סיוע הומניטרי ולהפסיק את הפגיעה באזרחים ובתשתיות אזרחיות.
הנציבות קוראת לישראל למלא באופן מוחלט את התחייבויותיה המשפטיות המפורטות בצווי בית הדין הבינלאומי לצדק על שניתנו ב-26 בינואר 2024, 28 במרץ 2024 ו-24 במאי 2024, ובמיוחד לאפשר לנציבות גישה לעזה כדי לנהל חקירות.